San José del Palmar, por su ubicación en la cordillera occidental y su condición selvática, es un corredor estratégico para el tráfico de economías ilícitas (actividades de cultivos de uso ilícito y narcotráfico). Según el PNIS, el municipio registra cultivos de hoja de coca en más del 60 % de su extensión geográfica, lo que corresponde a 653 hectáreas.