La Fiscalía General de la Nación estableció que la muerte de Torres Cardona fue ordenada por las Autodefensas Gaitanistas de Colombia, AGC, o Clan del Golfo, ante su negativa de entregar información sobre la ubicación de 34 lingotes de oro, avaluados en 4.500 millones de pesos.
Sebastián fue asesinado por un desconocido que le propinó múltiples disparos con arma de fuego cuando transitaba por la carrera 89A con calle 32, barrio Santa Mónica, jurisdicción de la comuna 12, La América.